Die Wohngrundschule entlässt ihre Schüler*innen mit einer Schulreife für das 5. Schuljahr und einer Schullaufbahnempfehlung, in der Regel für den Besuch des Gymnasiums, der Sekundarschule, der Realschule oder der Hauptschule. Schüler*innen mit einem ausgewiesenen Förderbedarf durchlaufen das Zuweisungsverfahren des Schulamtes Paderborn.
Die Schüler*innen können nach Beendigung der Grundschule auf Gut Böddeken verbleiben und von dort aus die weiterführenden öffentlichen Schulen besuchen. Nach Abschluss der 7. Klasse besteht dann die Möglichkeit, in eine der trägereigenen sozialpädagogischen Wohngemeinschaften in Büren, Wewelsburg oder Detmold umzuziehen und von dort aus die Schulkarriere fortzusetzen.
Unabhängig von der Schulformempfehlung haben die Kinder auch die Option, in die Jugendhilfeeinrichtung Schloss Varenholz im Kalletal zu wechseln. Bei dieser Einrichtung handelt es sich um eine Partnereinrichtung von Gut Böddeken, in dem die auf Gut Böddeken begonnene Fallführung fortgesetzt werden kann. Auf Schloss Varenholz besuchen alle Schüler*innen die staatlich genehmigte Private Sekundarschule, die Schüler*innen mit einer Haupt-, Real-, Gymnasial- oder Gesamtschulempfehlung durch individuelle Fördermaßnahmen zum gewünschten Abschluss führt.
